A Nemzeti Fejlesztési Hivatal az NFT tervezése során a következő alapelveket érvényesíti: Strukturáltság. A kormány az NFT kidolgozása előtt nyilvánosságra hozza a terv kidolgozásának folyamatát és menetrendjét. Az egyes civil szervezetek célszerűen ahhoz a tematikus vagy regionális munkacsoporthoz kötődően vehetnek részt a tervezés folyamatában, amelyekhez működésük földrajzi vagy tartalmi területe alapján a legszorosabban kapcsolódnak. A civil szervezetek véleményükre, felvetéseikre jórészt nem a Nemzeti Fejlesztési Hivataltól kapnak választ, hanem a felvetés területe szerint illetékes munkacsoporttól. Az NFH azonban minden véleményt és javaslatot nyilvántart, és ezt a nyilvántartást megőrzi.